我院成立于1953年，是政府举办的全额拨款的社会公益性事业单位，是全市妇幼保健计划生育技术指导与培训中心，担负着全市四县四区妇幼计生技术指导工作。是六安市首批“爱婴医院”、全市唯一的因医学需要终止妊娠的医学鉴定单位、六安新生儿疾病筛查中心、六安市产前筛查中心。先后获得“综合目标考核优秀单位”、“全市实施妇女儿童发展规划先进集体”、“全市维护妇女儿童权益先进集体”、“国家出生缺陷救助项目优秀项目实施单位”以及国家妇幼保健中心授予的妇幼保健机构监测“优秀组织管理”单位、国家妇幼科技科研“三等奖”、安徽省科学技术研究成果奖等荣誉。
市妇幼保健院新院区于2020年12月正式开工建设，2022年12月建设完成。项目概算总投资20809.85万元，建设地址位于齐云路以北、将军路以西、平桥乡政府南侧，用地面积21137㎡（约31.71亩），总建筑面积35315.08平方米。已于2023年12月正式投入使用。